Unweit der Schweizer Grenzen liegt das Anbaugebiet Jura. Es ist ebenfalls ein Département sowie eine Bergkette. Untergliedert in Côtes du Jura, Arbois, l´Étoile sowie Château-Chalon mit der Spezialität Vin Jaune. Die Bedeutung der Weinregion war früher deutlich größer, doch mittlerweile sind die Weine aus den autochthonen Rebsorten Savagnin (weiß) sowie Trousseau und Poulsard (rot) neben Chardonnay und Pinot Noir zunehmend gefragter. Vor allem durch die montanen Einflüsse und dem Kalkstein sind die Weine sehr eigenständig und gehaltvoll.